2004 ausgezeichnet mit der „Trophée Gourmet“ in der Kategorie Gourmandise für ausgefallene Produkte.

2005 Von Trend WKO als „Unternehmer des Jahres“ geehrt.

2006 erhält Zotter den „Trigos“ für Unternehmen mit gesellschaftlicher Verantwortung für die „Zeichen setzen“-Schokolade.

2006 erhält Josef Zotter als „Bester ausländischer Schokoladenhersteller“ den „Eurochocolate Award“ in Perugia, Italien.

2007 Zotter wird mit dem großen Preis der steirischen Wirtschaft „Primus 2007“ für sein Comeback ausgezeichnet.

Seit 2007 scannt Greenpeace den Konsumentenmarkt: Zotters Produkte schneiden in puncto: Ökologie - Inhaltsstoffe, Transport, Verpackung, Gentechnik sowie artgerechte Tierhaltung und soziale Aspekte immer wieder mit „hervorragend“ ab, manchmal sogar als einziger Hersteller.

2008 bekommt die Zotter Schokoladen Manufaktur den „Trigos Steiermark“ für das Projekt „Qualität statt Armut“ in Nicaragua.

2008 erhält Andreas h. Gratze den begehrten „iF – Packaging Award“ in der Kategorie Verpackungsgrafik.

2008 erhält Zotter „Best of Organic" für die handgeschöpfte Schokolade vom Organic Marketing Forum in Warschau.

2009 wird Andreas h. Gratze mit der Zotter-Grafik für den Designpreis der Bundesrepublik Deutschland nominiert.

2009 wählt die Europäische Kommission Zotter zum Leitbetrieb der KMU in Österreich.

2010 Zotter wird in die renommierte Harvard University eingeladen. Als einziges österreichisches Unternehmen steht Zotter jetzt als Fallbeispiel auf dem Lehrplan der Studenten.

2010 erhält Zotter den „Trigos Steiermark“ für das Projekt „Kakao statt Kokain“. Außerdem erhält er den „Sonderpreis von WIN“ (Wirtschaftsinitiative Nachhaltigkeit).

2010 wählt das größte österreichische Nachhaltigkeitsmagazin „Lebensart“ Josef Zotter zum nachhaltigsten Unternehmer 2010.

2010 wird Zotter von einer 300 köpfigen Jury für den "Top of Styria" nominiert und erhält in der Kategorie Innovation den 2. Preis.

2010 Zotter erhält das Gütesiegel „Erlebniswelt Wirtschaft – made in Styria“ für sein Schoko-Laden-Theater. 

2011 wird Zotter mit dem Academy of Chocolate silver award für die beste Bean-to-Bar Milchschokolade ausgezeichnet.

2011 bei der AC-Nielsen-Studie belegt zotter Platz 3 in der Kategorie Price Premium, direkt nach 1. Lindt, 2. Milka.

2012 Die Manufaktur wird als Klimabündnisbetrieb ausgezeichnet.

2012 ist Zotter für den European Business Award in der Kategorie Nachhaltigkeit nominiert. Zotter schafft es bereits in die dritte Auswahlrunde: National Finalist. Die Jury-Entscheidung fällt erst 2013. 

2012 Zotter gehört zu den 8 besten Schokoladenherstellern der Welt. 271 Unternehmen aus 38 Ländern und 2.700 Produkte testete Georg Bernardini für sein Buch „Der Schokoladentester“. Zotter gehört zu den Besten und klettert im persönlichen Ranking des Autors auf Platz 1 der Welt.